西安市儿童医院检验科成立于1959年，历经几代检验人的努力，目前已成为设备先进、检验项目齐全、质量管理规范，集临床、科研、教学于一体的现代化儿童专科医学实验室，于2019年通过了ISO15189医学实验室认可。

科室拥有一批专业能力优秀、人才梯队结构合理的技术队伍。现有工作人员68名，其中高级职称7名，中级职称28名，检验医师9名，博士2名，在读博士1名，硕士12名。2018年被评为国家住院医师规范化培训检验医学科基地。近年来，获得陕西省科技厅基金项目2项，西安市卫计委基金项目3项，作为西北分中心完成国家卫计委委托项目1项，出版医学检验专著1部，发表SCI论文9篇，发表核心期刊论文七十余篇。

科室设有8个亚专业实验室：生化室、免疫室、微生物室、临检室、门急诊实验室、HIV初筛实验室、分子诊断实验室、感染门诊实验室。